Już w sierpniu 2020 r. Emirates SkyCargo były jednym z pierwszych światowych przewoźników cargo, który rozpoczął opracowywanie globalnej logistyki transportu potencjalnych szczepionek na COVID-19. W październiku 2020 r. linie Emirates ogłosiły, że przeznaczą specjalny węzeł lotniczy z certyfikatem GDP do transportu szczepionek. W tym samym miesiącu, we współpracy z partnerami logistycznymi, dział cargo Emirates przewiózł przez Dubaj próbne przesyłki szczepionek przeciw COVID-19.
W czerwcu 2021 r. Emirates SkyCargo rozszerzyły infrastrukturę swojej sieci chłodniczej dedykowanej farmaceutykom na Międzynarodowym Lotnisku w Dubaju (DXB), umożliwiając przechowywanie dodatkowych 60-90 milionów dawek szczepionek przeciw COVID-19 w dowolnym momencie. Dzięki globalnemu wzrostowi dystrybucji i podawania szczepionek, Emirates SkyCargo ułatwiły transport większych ilości szczepionek przeciw COVID-19 z miejsc produkcji do miejsc docelowych, osiągając 250 milionów dawek do września 2021 r. i 600 milionów dawek do grudnia 2021 r.
Emirates SkyCargo to jeden z wiodących światowych przewoźników lotniczych cargo przewożący towary farmaceutyczne wrażliwe na temperaturę. Oprócz szczepionek przeciw COVID-19 przewoźnik przewozi inne krytyczne leki i farmaceutyki ratujące życie podczas swoich lotów do ponad 140 miejsc docelowych na sześciu kontynentach. Szacuje się, że samoloty Emirates przewożą każdego dnia 200 ton towarów farmaceutycznych.

